那曲县属高原亚寒带半干旱季风型气候，其特点是气温低、空气稀薄、大气干洁、太阳辐射强、日温差大。年平均气温-1.5℃，气温平均日差16.1°C。1月平均气温-13.2℃，年极端最低气温-41.2℃;7月平均气温9.0℃，年极端最高气温23.60℃；0°C以上持续天数164.5天，年日照时数2846.9小时。每年10月中旬至次年5月中旬为积雪期和土壤冻结期，年平均霜日103天，7-9月为高原植被生长期。平均年降水量421.9毫米，平均年蒸发量1690.7毫米，平均相对湿度54%。

那曲藏语意为“黑河”；整个地区在唐古拉山脉、念青唐古拉山脉和冈底斯山脉怀抱之中，西边的达尔果雪山，东边的布吉雪山，形似两头猛狮，守护着这块宝地。这片总面积达40多万平方公里的土地，就是人们常说的羌塘。整个地形呈西高东低倾斜，西高，中平，东低，平均海拔在4500米以上。中西部地形辽阔平坦，多丘陵盆地，湖泊星罗棋布，河流纵横其间。东部属河谷地带，多高山峡谷，是藏北仅有的农作物产区，并有少量的森林资源和灌木草场，其海拔高度在3500－4500米之间，气候好于中西部。

那曲行署所在地那曲镇是青藏公路的必经之路，又是西藏对外开放的旅游区之一。旅游者可以领略藏北草原的自然风光、节日气氛和民族风情，还可以参观游览藏北名寺孝登寺。在那曲地区境内，辽阔的羌塘草原和神秘的藏北无人区，都会给旅游者留下深刻的印象，尤其是一望无际的无人区，栖息着野牦牛、藏羚 、野驴等许多国家一级保护动物，给这片神奇的土地增添了更加迷人的色彩。藏北宰湖纳木错位于拉萨市的当雄与那曲地区的班戈县之间，每年都有许多前来转湖的游客和信徒。