以中国甘肃敦煌莫高窟所藏医学卷子本为主的一批出土的隋唐及其以前的医学文献。1900年，在甘肃敦煌莫高窟藏经洞发现4万余件手写本和少量的木刻本。国内外学者对其进行了大量的整理研究，成果斐然，以至形成了新兴的国际显学——敦煌学。医学文献只占敦煌文献的很小一部分。自敦煌文献发现之后，又陆续在新疆、甘肃、青海、四川等地发现了许多古卷写本，其中也有少量医学文献。现代学者一般将它们归入敦煌医学文献进行研究。

敦煌文献除中国国家图书馆藏有一万余卷之外，其余都为当时英、法、俄、日等国探险者所获，收藏于英国国家图书馆、法国国立图书馆，以及德国、俄国、日本、美国、印度等国。经调查研究，现存于国内外的敦煌医学卷子约有93种，其内容涉及医经、五脏、诊法、伤寒、医方、本草、针灸、养生等方面。这些医学文献多撰成于六朝及其以前，也有部分系隋唐时期的医学文献。这些文献中有许多长期失传的医药古籍，以及一些流传至今的古籍最早的传写本，最能反映早期医学文献原貌，因而对研究中国医药发展史、澄清医药文献的部分疑难问题，以及对校勘、补缺和探求宋以后的木刻本的源流，都具有非常重要的价值。

20世纪，有关敦煌医学文献的研究日益增多并不断深化。最初的研究集中在少数敦煌出土的医药专著。由于当时条件的限制，研究者们在原始资料的复制方面致力尤多。随着世界敦煌学的发展和复制技术的进步，世界各国陆续影印出版敦煌出土文献，促进了敦煌文献的研究。90年代以后，中国有关敦煌医学文献的系统研究蓬勃开展，出版了《敦煌古医籍考释》等多种学术专著。敦煌医学文献的研究作为敦煌学的重要组成部分，正在向纵深发展。