畲族有语言，而无本民族文字，其古代文献遗留较少，现大多从民间收集代代相传的医药经验即所谓口碑文献来加以整理总结。近年来，我国浙江、福建等地开展了畲医理论和临床研究工作。

疳积理论 狭义之疳积指小儿因饮食不当、吸奶过及、天赋不足等因素而致小儿面黄肌瘦、小腹膨隆等症，称小儿疳疾。广义之疳积泛指风、寒、痧、食等因素而引起的诸多杂病的总称，畲医统称为疳积病。畲医认为，人体的许多疾病都是由于疳积而成。其病机是因风、寒、痧等邪气侵犯肌体，或因过食肥甘厚腻之品，或因久病不愈，耗损胃气，而使脾胃虚弱，运化无力，气机壅滞，风、寒、痧等邪气积滞而成。疳积病在临床上根据病因及病变部位分为风积、寒积、痧积、食积、木积、土积、水积、火积、金积、气积、血积、痰积等。临床中的诸如冠心病、脑梗塞、三高症、糖尿病、脂肪肝、肿瘤等疾病都根据这一机理进行辨证施治。

六神学说 由心神、肝神、肺神、脾神、肾神、胆神组成。畲医认为人体生命活动的基本物质由气、血、精组成。畲医六神学说，认为气、血、精是组成人体并完成机体各项活动的基本物质基础，若六脏腑神魂失守，六神就不能发挥神的主宰功能，气、血、精化生不足或运行、输布失常，机体的各项功能活动就会发生病理变化，如不及时予以调整与治疗，就会影响甚至危及人体的生命活动。

痧症理论 畲民在与疾病斗争的实践经验中不断认识和总结了独特的痧症，并逐渐形成了痧症理论、发痧疗法。畲医认为痧症的发病原因广泛而复杂，在长期的发病与疾病斗争过程中认识到痧症的病因主要为“痧气”，并形成了“痧气”致病学说。一年四季均可发生，但多见夏秋湿热气盛之时。痧症发病极为广泛，病种涵盖了内、外、妇、儿、五官、皮肤、骨伤等科。

畲医独特的病名 浙江省丽水市畲族医药研究所研究人员，将2001年至2006年间调查收集到的776种原始病名进行分析，最后归并为450个病名。由于受中医的影响，很多病名与中医类同。较独特的畲医病名如热蛇、阴蛇、飞丝落肚、风寒入肚、吊气、头养风火、风动头晕、风火烧、风气阴子肿、骨底烧、寒火烧黑风、横胎红痢、落白、冷汗症、湿热痢、铁板症中风、吊眉风、鸡爪疯、寒邪伤经、阴毒、虚汗症、鬼剃头、黄风、黑风、红风等，有待于进一步研究。