蒙医药学治疗强调“求本”“扶正祛邪”“调理三根”和“因人、因时、因地制宜”等治疗原则，采取以药物、外治、饮食起居等多种疗法相结合的综合性治疗手段。

除药物治疗以外，蒙医技术还有灸疗、放血、针刺、正骨、震脑、冷热敷、蒙药浴、马奶酒疗法、天然温泉疗法等。

蒙医温针疗法

蒙医药学对疾病进行治疗的方法大约可分为三种，即营养方法、削弱方法和手技方法。所谓“营养法”，就是通过饮食调节，增强病人的体质，使失衡的三根，重新得以平衡的一种治疗方法。所谓“削弱法”，就是通过服用泻下、催吐等药物，削弱希拉，使赫依相对得到滋补，从而重建体内三根平衡的一种治疗方法。所谓“手技法”，其实就是用手法技巧治疗器官移位，肢体挫伤和断裂等的一种外治疗法。饮食、药物、外治，再加上起居，这四个方面的治疗方法，在传统蒙医学著作中，又被称为“临床对治四施”。