侗医药事业的发展与其他民族医药一样，都是在党和国家的民族政策指引下快速发展起来的。侗族是有语言而无文字的民族，侗族虽然民间有很多医药书籍的手抄本，但直到上个世纪90 年代，《侗族医学》一书问世，才比较系统地阐述了侗族医药的基础理论、理法方药等，结束了侗族医药没有文字记载的历史，为今后深入研究侗族医药开了先河。2004年成立了中国民族医药学会侗医药专家委员会，并先后召开了5次全国侗族医药学术研究会。近十年来先后出版了《侗医吴定元小儿推拿经验》《侗族药物方剂学》《侗族常用药物图鉴》《中国侗族医药》《侗族医药探秘》《侗族药用物种》《湖南世居少数民族医药宝典》《侗药大观》《中国侗族医药研究》与《中国侗医药史》等著作，获湘黔桂三省地市有关侗族医药科技进步奖十余项，侗医药事业得到了较快的发展。

现在侗区很多中医院开设了侗医门诊或侗医专科，如通道侗族自治县中医院设有龙氏骨伤专科和侗医专科，三江侗族自治县中医院设有侗医专科，这些侗医专科目前主要开展了侗医外治法，用侗药进行治疗。贵州省黔东南天柱侗医精神病专科医院用侗药治疗癫症、狂症、癫狂症与癫痫病。贵州省黔东南苗族侗族自治州于1984年4月成立了州民族医药研究所，2012年更名为黔东南苗族侗族自治州民族医药研究院，并与州中医院合并。主要从事苗、侗医药研究，在侗医药研究方面取得了显著的成果。贵州省黔东南苗族侗族自治州民族医药研究院的苗侗药物标本馆为全国第一个苗族侗族药物标本库，接待了来自世界多国有关药学专业的专家、学者的考察和参观。湖南省通道侗族自治县侗医药研究所成立于2010年，主要进行侗医药临床应用及侗医药文献整理。附设侗医药诊所，主要临床方向为侗医骨伤科应用。出版《侗族医药探密》《侗药大观》等侗医药研究著作4部，获怀化市科技进步二、三等奖各1项。民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室于2008年9月组建，2011年7月通过省科技厅组织的专家组验收。实验室目前有民族药用植物资源多样性及其保护、民族药用植物资源遗传改良与规范化栽培和民族药用植物资源开发利用3个研究方向，设有民族药用植物资源多样性保护研究室等4个研究室。