林芝市有5个自然保护区:雅鲁藏布大峡谷自然保护区;察隅自然保护区;波密岗乡自然保护区;林芝巴结巨柏自然保护区;林芝东久赤斑羚自然保护区。林芝地区有3个文物保护点:位于墨脱县的公元十七世纪的墨脱藤网桥;位于巴宜区的公元798至815年的工布第穆萨摩崖石刻;位于朗县的吐蕃时期的列山墓地。

旅游资源:林芝市旅游资源十分丰富，除5个自然保护区和3个文物保护点外，仅尼洋河区域就有8大景区，40处景点，神山圣湖令人神往。主要景区有世界第一的雅鲁藏布大峡谷景区，巴松湖国家4A级景区，娘蒲景区，色季拉山国家森林公园景区，波密易贡国家地质公园景区等。同时，还有布久喇嘛岭寺朝圣旅游区、易贡茶园生态旅游区、雅江民俗文化旅游区、市镇综合旅游区等等。景区内有圣佛寺庙、星罗棋布的湖泊、风景奇异的壮观山峰，还有珞巴新村的民俗风貌以及千年古墓、雄伟山体、飞流瀑布、古柏苍松，这些都是开发旅游、科考、探险、漂流、攀岩、登山、休闲的理想之地。