明初因元旧制，平谷县仍为蓟州属县。

　　清初，平谷县仍为顺天府蓟州属县。民国二十三年（公元1934年）《平谷县志》记载：清康熙十五年（公元1676年），分平谷等县属通永道。雍正四年（公元1726年），以通永道专司河务，平谷改属霸昌道。乾隆八年（公元1743年），以平谷县直隶顺天府。

　　1914年（民国三年），改顺天府为京兆特别区，领县二十，平谷县为其一。1928年（民国十七年），国民党政府迁都南京，裁京兆特别区，划归河北，平谷县改隶河北省冀东道。1932年（民国二十一年）9月，河北省设蓟密行政督察专员区，下辖平谷。

　　抗日战争时期，八路军第四纵队于1938年6月在镇罗营建密（云）平（谷）蓟（县）联合县，7月打下平谷县城，建立平谷县抗日民主政府。中国共产党领导军民开展抗日斗争，于1940年4月建立蓟（县）平（谷）密(云）联合县，隶属于晋察冀边区行政委员会冀东办事处，7月改属晋察冀边区行政委员会第十三专属（简称第十三专署）。随着抗日根据地的扩大，抗日武装力量的壮大，1940年11月，蓟平密联合县一分为二，南部建立蓟（县）宝（坻）三（河）联合县，北部建立平（谷）密（云）兴（隆）联合县。为巩固平密山区根据地，并向三河县发展，1942年11月，平密兴联合县改为平（谷）三（河）密（云）联合县，均属第十三专员公署。1943年7月，根据冀热边特委“县划小，区划大”决定，平三密联合县划分为两个联合县，北部建立承（德）兴（隆）密（云）联合县，南部将蓟县盘山地区划入，建立平（谷）三（河）蓟（县）联合县，通称老平三蓟联合县，隶属于冀热边行署第一专署。由于抗日根据地的恢复与扩大，1944年7月，平三蓟联合县一分为三，西部建立三（河）通（县）顺（义）联合县，西南部建立三（河）通（县）香（河）联合县，东部仍为平三蓟联合县，通称新平三蓟联合县。1944年隶属关系未变。1945年1月，冀热辽行署建立，平三蓟联合县隶属冀热辽行署第十四专署。这些联合县，抗战中变动频繁，县政府机关常活动于北部山区，时无定所。

　　抗日战争胜利后，仍沿用联合县建置。1945年11月，平三蓟联合县隶属于冀东行署第十四专署。1946年3月，撤销联合县建置，恢复单一的平谷县，隶属关系未变。1949年8月，河北省人民政府成立，原第十四、十五专区的部分地区合并为通县专区，平谷县隶属于河北省通县地区行政督察专员公署。

　　新中国成立后，平谷县仍隶属河北省通县专署。1958年3月，通县专署撤销，平谷县改属河北省唐山专署。同年10月20日，平谷县划归北京市。2002年4月，平谷县撤县建区，揭开新的历史篇章。