马祖塔亭坐落在靖安县宝峰镇宝峰禅寺后面，为中国佛教禅宗南天八祖马祖道一而建造。
唐贞元四年（788年）正月，马祖80岁时率弟子登建昌石门山（今靖安宝峰），爱其山水奇胜、洞壑平坦，遂对随行弟子曰：“吾朽质之日，归骨于此”。同年二月初一圆寂。弟子遵其嘱，奉灵骨舍利藏于寺后窖中。
唐贞元七年（791年），德宗李适派左仆射同平章事权德舆来到建昌石门山内为保存马祖灵骨舍利而造塔，权亲撰塔铭。元和八年（813年）宪宗李纯赐马祖谥号为“大寂禅师”，塔号为“大庄严”。大中四年（850年），宣宗李沈令江西观察使裴休重修马祖塔，并敕赐塔额为“宝峰”，故寺亦易名为“宝峰禅寺”。 后又有人建木亭以护卫。宋元丰八年（1085年），又重新建造石亭以护之。亭高5.5米，深5.17米，六柱六角宝盖式顶，全身用花岗石为材料榫接而成。檐首六角均有昂首龙头石雕。亭外用十二块扇形石板覆盖，内顶上方呈南北方向架着一根粗壮主石梁，重约5吨，石梁下方刻有“圣宋元丰岁次乙丑五月癸巳朔廿八日庚申琢石重新建造□蹟”阴文。亭正面为敞开拱门，其余5面用青石板全封闭或半封闭。亭下为墓塔，塔基下珍藏着马祖的灵骨舍利。亭的左右两旁各有一蔸桂花树，金秋时节，芳香四溢。
马祖舍利塔在“文革”初期被毁。1993年由宝峰寺住持一诚大师按原塔样式重建，材料是从山东精选而来的汉白玉，仍由塔基、塔身、塔刹三部分组成，通高3.78米。塔基为正方形须弥座。塔身南面石碑竖刻着当代书法家启功题写的“马祖道一大寂禅师舍利之塔”，碑的左方刻“癸酉年清和月启功敬题”字样；北面碑刻为中国佛教协会副会长周少良竖书的“心外无别佛，佛外无别心”两行字；西面碑文为本寺方丈一诚长老所撰、时任本县县长郭明所书《马祖塔铭》；东面石碑重新镌刻唐代左仆射权德舆所撰《马祖塔铭》。塔刹下为仿斗拱造型，上为琉璃瓦造型，檐首六角均有含珠龙头饰物，顶为净瓶形。塔基底下珍藏着马祖灵骨舍利，为錾花鎏金银盖罐所盛，外用一白帆石石函所包装。
马祖塔亭属江西宋代石建筑的珍品，加上权德舆所撰写的塔铭，对研究佛教禅宗学说的传播具有很高的历史价值；对古人运用力学原理构架如此巨大的石亭亦有很高的科研价值。1957年马祖塔亭被江西省人民政府定为省级重点文物保护单位，并为《中国名胜辞典》等书所收录。