柯坪县位于新疆南疆西北部，阿克苏地区最西端，东经78°02′-79°57′，北纬40°02′-40°57′，处于天山支脉阿尔塔格山南麓、塔里木盆地北缘，东与阿克苏市、阿瓦提县相邻，西南与喀什地区巴楚县接壤，西北与乌什县和克孜勒苏柯尔克孜自治州阿合奇县相连。东西长164公里，南北宽105公里，全县总面积8912平方公里，其中：山区面积6238平方公里，占县域总面积的70%。

柯坪县属大陆性暖温带干旱气候，日照充足，降水稀少，年均降水量仅为73.8mm；蒸发量大，年均达2864.8mm；全年径流量1.26亿m3，年引用水量9950万m3。全年日照时数2788小时，日平均为7.6小时，日照百分率为63%；年平均气温11.4℃，气温最高43.1℃，最低-29.3℃，平均日温差14.6℃；年平均无霜期215天，是阿克苏地区光热资源最丰富，最适宜发展有机农产品的县之一。