沿山门向北为「北极玄宫」，即灵应寺过殿。原殿内正面有韦驮菩萨像，韦驮菩萨四周有坐佛八尊。民国年间李相之的游记中对灵应寺有这样的记述∶两殿摆设，都很整齐。正殿五间，特别高大，所用木料，都很笃实。殿顶的瓦是黄绿色琉璃瓦，砌成棋盘形。门额巨匾上书∶「毗卢真境」，为康熙八年（一六六九年）立，明代隆庆年间（一五六七年至一五七二年）曾对灵应寺予以重修，一九八六年又重修葺，正殿为三间石洞，内供无垢文殊菩萨。

二○○一年，灵应寺再度扩建和维修。新建文殊殿五间、龙王殿三间及石牌坊一座，均为汉白玉石砌筑。大殿单檐歇山顶，门窗拱券，前置廊，门前左右各置石狮一尊，左右偏殿为悬山顶，廊间柱头饰以石制斗拱，整体设施简洁明快，稳重大方。龙王殿置於两米高的高台上，面阔三间，拱卷式门洞，也是单檐歇山顶。殿前有汉白玉石雕护栏，护栏栏板浮雕各种各样的花卉、草叶纹饰，极为壮观。