地上车站5座，分别为：线路南端的小行站、安德门站、中华门站，线路北端的红山动物园站、迈皋桥站。

　　地下车站11座，分别为：西延部分的奥体中心站、元通站、中胜站和南北向主线的三山街站、张府园站、新街口站、珠江路站、鼓楼站、玄武门站、新模范马路站、南京站站。