卧龙自然保护区是全球生物多样性热点区域，拥有脊椎动物 450 种、高等植物近 4000 种，其中国家重点保护珍稀动植物 81 种四川卧龙国家级保护区管理局。以下按保护级别与类群整理核心物种与关键信息：
国家一级重点保护物种（核心旗舰）
动物
表格
物种 核心特征 栖息海拔 保护价值
大熊猫 主食箭竹，圈养繁育与野化放归核心区，约 104 只野生个体 2300-3200 米 邛崃山系核心种群，全球旗舰物种
川金丝猴 群栖、蓝脸金毛，树栖为主 2000-3500 米 中国特有，高山森林生态指示种
雪豹 高山顶级捕食者，红外相机高频记录汶川卧龙特区 3400-4600 米 邛崃山系存在证据，生态平衡关键
四川羚牛 大型偶蹄类，群栖，冬季下移 2500-4000 米 横断山特有，森林 - 草甸生态关键种汶川卧龙特区
林麝 产麝香，独居夜行 2000-3500 米 药用价值高，野外种群极稀
绿尾虹雉 中国特有，羽色绚丽，“高山美人” 3000-4200 米 高山草甸 - 灌丛指示种
植物
表格
物种 核心特征 生长海拔 保护价值
珙桐 / 光叶珙桐 中国特有，“鸽子树”，花序如白鸽展翅 1500-2200 米 第三纪孑遗，观赏与科研价值极高
红豆杉 含紫杉醇，常绿乔木 1800-2800 米 抗癌药用价值，国家一级保护
国家二级重点保护物种（代表类群）
动物
兽类：小熊猫、藏酋猴、岩羊、豹猫、水鹿、中华斑羚等，常见于森林与灌丛，是大熊猫伴生种汶川卧龙特区。
鸟类：红腹角雉、藏马鸡、血雉、金雕、胡兀鹫等，高海拔草甸与森林常见，生态链重要环节汶川卧龙特区。
植物
代表物种：连香树、水青树、伯乐树、油樟、红花绿绒蒿、四川红杉等，多为孑遗植物，对研究植物演化意义重大。
新发现物种：2020 年后发现熊猫马先蒿、卧龙无柱兰、卧龙盆距兰等 5 个新种，丰富区域植物多样性阿坝州政府。
其他珍稀与特有物种
植物：垂茎异黄精（IUCN 濒危）、麦吊云杉、高山杜鹃等，垂直带谱完整，含多个狭域特有种四川省林业和草原局。
昆虫与两栖：约 1700 种昆虫，含多种特有蛾类、蝶类；两栖类如大鲵（野外偶见），爬行类以蝮蛇、草蜥为主。
观测与保护贴士
动物观测：核心区需特许，邓生沟、巴朗山垭口、甘海子等外围区域可遇岩羊、藏酋猴、红腹角雉等；熊猫苑与博物馆可稳定观赏圈养大熊猫与科普展品。
植物观赏：4-5 月高山杜鹃（巴朗山、卓西牧场），5-6 月珙桐开花（耿达 - 卧龙镇沿线），9-10 月连香树、四川红杉彩叶绚烂。
严格遵守保护区规定：核心区禁止擅自进入，徒步走官方栈道，不投喂、不采摘、不干扰野生动物
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