全市境内拥有航道82条，可通航里程798公里。主要航道有东江干流、东莞水道、太平水道、麻涌水道、中堂水道、倒运海水道、大汾北水道和寒溪水水道。其中东莞水道1993年由7级航道改造为4级航道，可通航500吨级以下船舶。拥有河口海岸线53公里，万吨级轮船可沿珠江口狮子洋水道进入虎门、沙田、麻涌三镇。

　　【港口】

　　全市共有大小码头123座，泊位207个，码头泊位总长为1.3万米。

　　东莞位于珠江出海口，虎门历来就是我国南方的重要门户，溯珠江而上，可分别通达粤东、粤北、粤西乃至广西等地。主要港口——虎门港是国家一类口岸，对外国籍船舶开放，每天都有客货轮直达香港。目前虎门港已建成2000吨级至35000吨级泊位11个，设计能力600万吨，同时，还有莞城港区、石龙港区和中堂、望牛墩、麻涌、新民、洪梅等一批水路进出口货物装卸点，港口货物集散非常方便。

　　【机场】

　　东莞虽然没有自建机场，但周边有多外机场可供利用。沿广珠高速公路，五十公路内北有广州云机场，南有深圳机场；一百公路左右有珠海机场、佛山机场以及香港新机场。

　　从东莞前往广州以及深圳的机场都非常方便，既可以乘坐火车也可乘坐长途汽车前往，而且市内设有多个民航代办处和40多个业务点，办理各航线客货运输业务甚为便捷。

　　市航服票务有限公司（东城创业路）电话：0769—22477226、0769—22477433

　　东莞市新华航空服务有限公司（东城西路262号）电话：0769—22387711、0769—22387722

　　虎门航空代理服务公司电话：0769—85523239、0769—85502999

　　东莞机票订票电话：0769—22227200

　　【站场】

　　1、客运站场，全市现有客运站场47个，总面积38.9万平方米，其中一级站1个，二级站9个，三级站3个，四级站8个，简易站场（含专线发车点）26个。站务量为日发班次3300班，日过往班次580班，2001年日均发送量135500人次，比上年同期增长8.83%。

　　2、货运站场。目前东莞市没有货运站场，有三个物流中心，分别是篁村的龙骏物流中心，南方物流中心和塘厦利沣物流中心。

　　【运输运力和线路分布状况】

　　全市现有营运汽车78883辆，124747吨位，131740座位；其中营运货车71805辆，营运客车7078辆。营运汽车中，客运班车3704辆，114292座位；旅游客车17辆，663座位；出租客车3357辆，16785座位。全市拥有船舶536艘，总载重吨152849吨，其中出港澳船舶166艘，总载重吨90656吨。

　　截止2001年底止，全市拥有客运班线839条，日发班次3434班；其中跨省线路204条，日发245班次；跨地（市）111条，日发389班次；地（市）内524条，日发2800班次。班线839条， 日发班次3434班；其中跨省线路204条，日发245班次；跨地（市）111条，日发389班次；地（市）内524条，日发2800班次0。

　　1、市公共汽车总公司。

　　目前唯一的全市性公共汽车营运企业。拥有营运车辆583台（其中莞邑公司103台），其中双层巴士18台，开通公交线路45条，通车里程达1300公里，基本覆盖全市各镇（区）和边远管理区。

　　2、各镇（区）公共汽车。

　　目前全市拥有各镇（区）成立的公共汽车18家，主要在各镇辖区内运行，拥有运力236台大中巴士。

　　东莞公交车查询热线：0769—95001666

　　东莞城巴公交服务电话：0769—22492253

　　3、市内专线营运车。

　　目前经营市内专线客运的企业有31家，共投入948台大巴运力，共开辟31条市内专线。

　　4、出租小汽车。

　　全市共有24家出租小汽车公司，拥有出租小汽车3357辆，16785座位，分布于城区和各镇区之间运营，以捷达、夏利等车型为主。出租车有三个档次，分别为：起步价5元，1.8元/公里；起步价6元，2.0元/公里；起步价7元，2.4元/公里。

　　东莞出租车查询电话：0769—22201777

　　5、旅游专线

　　目前东莞开设有5条旅游专线，能够到达虎门、林则徐公园、沃尔玛购物广场、樟木头林场等旅游景点与购物娱乐中心。

　　其中，1号线（东莞至虎门）全程票价10元；2号线（东莞至常平隐贤山庄）全程票价11元；3号线（东莞至樟木头观山公园）全程票价12元；4号线（东莞至石龙金沙公园）全程票价6元；5号线（莞城至绿色世界）按上车每票2元统一收费。

　　除此之外，东莞还开设有1条旅游观光线路，票价10元，观光为主。

　　【路桥及其收费站】

　　全市桥梁总数738座，总长92093延米，其中特大桥21座，大桥152座，中桥232座,小桥333座。 

　　经省人民政府批准，东莞市于2005年3月31日零时试行路桥收费年票制。东莞市内原有的25个收费站撤并后调整为17个。东莞市内的曲海大桥、大王洲桥、高埗大桥、寮步、石排、状元笔、峡口、企石、望东、樟木头、常平12个收费站将于3月31日前全部撤销。在与周边交界处重新设置塘厦、雁田、黄江、江南大桥、桥东大桥、石碣大桥、石龙大桥、石龙南二桥、谢岗、沙田10个双向收费站；在长安、黎光、桥头、田寮、燕窝、潢涌、麻涌设7个单向收费站。

　　实施撤并后，东莞市设置的17个收费站，其中江南大桥、石碣大桥、石龙南桥、石龙南二桥、黄江、谢岗、雁田、塘厦、长安9站属于保留旧站，沙田、黎光、桥头、田寮、燕窝、潢涌、桥东大桥、麻涌8站属设立（迁移）收费站。