侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆是在邓小平亲自关心下，于1985年8月15日建成开放。经过30多年的建设与发展，已经成长为具有较高国际知名度的纪念馆。

　　目前，纪念馆含侵华日军南京大屠杀史实展、“三个必胜”主题展、“二战中的性奴隶——日军‘慰安妇’制度及其罪行展”等三个基本陈列，展示了南京大屠杀、日军“慰安妇”制度、中国人民抗日战争伟大胜利的历史。共展出近4000幅照片，9992件各类文物，262部影像资料，智慧而严肃地表达了暴行、抗争、胜利、审判、和平五大主题。其中，美国牧师约翰·马吉牧师用于拍摄南京大屠杀历史影像的摄影机和影像资料已经被联合国教科文组织列入《世界记忆名录》。

　　纪念馆内现存三处南京大屠杀“万人坑”遗址，分别展示了1984年、1998-1999年以及2006年发现的遇难同胞遗骸。2015年12月，“三个必胜”新展馆和分馆南京利济巷慰安所旧址陈列馆建成后，纪念馆总占地面积10.3万平方米，建筑面积5.7万平方米，展陈面积达2万平方米。分布有7处广场、23座单体雕塑和一座大型组合雕塑、8处各种形式的墙体、17座各种造型的碑体。

　　纪念馆是关于南京大屠杀历史、日军“慰安妇”制度、世界反法西斯战争胜利的综合型博物馆，大量的文物、照片、历史证言、影像资料、档案以及遗址对历史真相做了完整的阐述，每年都会投入资金对南京大屠杀幸存者、“慰安妇”制度受害者、抗战老兵等群体进行援助。

　　自1985年8月15正式建成开放以来，截止到2018年底，共接待来自100多个国家和地区的观众近亿次。先后接待了习近平等多位党和国家领导人，以及丹麦女王玛格丽特二世、美国前总统卡特、捷克总统泽曼、日本前首相村山富市、海部俊树、鸠山由纪夫、福田康夫、哥斯达黎加前总统、诺贝尔和平奖获得者——阿里亚斯，澳大利亚参议院议长玛格丽特·里德、韩国前总理姜英勋等；30多个国家的驻华大使、驻沪总领事也曾来馆参观。近年来，近百次接受来自美国、英国、加拿大、日本、西班牙等国家和香港、澳门等地区的媒体采访。

　　纪念馆1997年被评为全国首批爱国主义教育示范基地，2006年被国务院颁布为“全国重点文物保护单位”，2008年被评为全国首批“国家一级博物馆”，2015年被中央精神文明建设指导委员会评为全国文明单位，2018年被评为“改革开放40周年”优秀先进集体。

　　从2014年12月13日起，纪念馆作为南京大屠杀死难者国家公祭仪式的固定举办地。