明代是潭柘寺的兴盛时期，这首先得益于明初重臣姚广孝。

明建文帝削藩时，明成祖朱棣就是按照姚广孝的谋划，起兵“靖难”夺取的皇位。

功成名就之后，姚广孝辞官不做，而到京西的潭柘寺隐居修行，每日里与自己的老友，潭柘寺住持无初德始禅师探讨佛理。

期间，明成祖朱棣还曾到潭柘寺看望过他。

据说当年修建紫禁城时，设计师就是姚广孝，他从潭柘寺的建筑和布局中获得了不少灵感，

例如太和殿就是仿照潭柘寺的大雄宝殿而建的，同为重檐庑殿顶，井口天花绘金龙和玺，所不同的是更高大了一些而已。