位于山南雅砻河东岸的贡布日山南麓，距乃东县约二公里，属格鲁派寺院。建于松赞干布时期，据说文成公主曾在该寺驻足修行。藏语中，昌是鹰、鹞的意思，珠是龙的意思。相传此地在建寺前有一恶龙，被松赞干布化身为大鹏降伏后才得以建寺，故得名。莲花生和米拉日巴等著名的人物都曾在昌珠寺四周修行，其修行地遗址仍存，是佛教信徒朝拜的圣地。

昌珠寺珍珠唐卡为镇寺之宝，所画的是坚期木尼额松像（观世音菩萨憩息图）。整个唐卡长2米，宽1.2米，共耗珍珠26两（计29026颗），镶嵌钻石一颗，红宝石二颗，蓝宝石一颗，紫宝石0.55两，绿松石0.91两（计185粒），珊瑚4.1两（计1997颗），黄金15.5克。这幅价值连城的唐卡能保存至今，实属不易。

昌珠寺系吐蕃时期第一批兴建的佛教寺庙之一，古往今来一直是山南的政治经济中央之一。目前整坐寺庙正在进行为期三年的大维修但也能一睹其镇寺之宝--珍珠唐卡.