横贯淮安市境内的淮河苏北灌溉总渠一线是我国暖温带和亚热带的分界线，因此淮安市兼有南北气候特征，一般说来，苏北灌概总渠以南地区属北亚热带湿润季风气候，以北地区为北温带半湿润季风气候。受季风气候影响，四季分明，雨量集中，雨热同季，冬冷夏热，春温多变，秋高气爽，光能充足，热量富裕。

全市年太阳辐射总量在110 千卡/平方厘米—119 千卡／平方厘米之间，全市分布为北多南少；全市年日照时数在2136 小时—2411 小时之间，日照时数分布也是北多南少。
    全市年平均气温为14.1℃ —14.8℃ ，基本呈南高北低状，受洪泽湖水体影响，在洪泽湖区形成一暖中心。气温年分布以7月最高，l月最低。全市年无霜期一般在210天一225天左右，北短南长，受洪泽湖区水体影响，洪泽县无霜期最长达236天。
    全市各地年降水量多年平均在906 毫米～l007 毫米之间。降水分布特征是南部多于北部，东部多于西部。降水年内变化明显，夏半年降水集中。春夏之交梅子成熟季节多锋面雨，称为“梅雨”或“霉雨”。降水年际分布不均，年降水量最多的年份达1700毫米以上，最少的年份只有500毫米。

全市年平均风速在2.9米/秒～3.6米/秒，以偏东风和西南风为主。

由于气候的过渡性和季风年度强弱不均、进退的早迟，因此淮安市也是气象灾害多发地区。主要气象灾害有：暴雨、洪涝、干旱、寒潮、霜冻、连阴雨、冰雹、热带风暴、龙卷风等。
    根据考古发掘和科学研究证实，远古时代的淮安气候比现在还要温润得多。早在新第三纪，市境西部的丘岗地区还是海滨陆地，是古脊椎动物的乐园，这里的古生物化石异常丰富，被国内外考古学家誉为“化石宝库”。